系统生物学+数学模型!双剑合璧挖掘肿瘤的致命弱点,鲁索替尼乳膏代购

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系统生物学+数学模型!双剑合璧挖掘肿瘤的致命弱点,鲁索替尼乳膏代购 。
鲁索替尼(JAKAVI)摘 要:鲁索替尼乳膏白癜风。系统生物学+数学模型!双剑合璧挖掘肿瘤的致命弱点,鲁索替尼乳膏代购撰文 | 小陈责编 | 雪月#健康科普排位赛#Eileen Kapotes是一名50多岁的教师,在之前与乳腺癌作斗争的四年中,包括全脑放射治疗在内,同时她一直在服用乳腺癌药物赫赛汀,但她的病情仍未得到有效控制。2016年,医生邀请她参加一项药物的临床实验,这使得她有机遇尝试一种截然不同的治疗方法——名为ruxolitinib的药物,该药最初的宗旨在于治疗血液和骨髓相关的癌病。
ruxolitinib是哥伦比亚大学的系统生物学家Andrea Califano历时十年的研究产物。通过复杂的计算,他对维持癌细胞的分子网络进行建模,并将转录因子精确定位。Califano与José Silva合作,分析了其他患病者对赫赛汀耐受药物的组织中的乳腺癌样本。分析结果表明,STAT3的转录因子在那些癌病中起着至关重要的作用。并且已知ruxolitinib能够抑制STAT3。
该策略以计算机算法为基础。通过使用数学模型模拟复杂的生物系统,如基因的互相作用等,Califano开发的算法是系统生物学的一个典型例子。Califano表示,他们已经建立了能够对每种不同肿瘤的特征进行逆向工程的算法,以便于了解药物的靶标。该领域已经引发起了科研人员们的极大兴趣,但很少有在临床上取得成功的例子。
如果将肿瘤细胞的关键基因定位在异常调控网络上游较远的位置,靶向抑制它们将是一项艰巨的任务。但是靶向抑制调控肿瘤异常网络中的“瓶颈因子”也能够达到同等的疗效【1】。
扼住肿瘤的喉咙
2015年,Califano与他的合伙人Gideon Bosker共同创立了DarwinHealth公司。该公司应用Califano的算法,通过识别患病者肿瘤中的关键转录因子,并向医生建议靶向药物物。尽管有人指出这种方法仅处于人体测试的早期阶段,其临床用途仍不完全明确,但这项工作仍赢得了许多其他研究人员的认同。
Andrea Califano(右)和Gideon Bosker(左)创立了DarwinHealth,将系统生物学应用于癌病
即将对Califano的算法进行最大的检验。哥伦比亚大学已投入1500万美元经费,用于在未来3年内,对其医院中的3000名癌病患病者进行临床实验,使用DarwinHealth公司的算法分析每个患病者的癌病,并推荐适用于每个患者的治疗方法。
Califano的算法的基础数据来自于转录组分析。该算法处置大量的RNA-seq数据,以揭示与健康组织相比,哪些基因在癌病中过度表达或表达不足。然后,算法使用方程式推断基因互相作用的模式,并在影响最大的转录因子上归零。
Califano与Mariano Alvarez合作开发了通过这些网络进行分类别的更有效算法。目前,他们开发的名为VIPER(通过调节子分析虚拟推断蛋白质活性)的算法已被用于数十项关于遗传网络在膀胱癌、前列腺癌和肺癌中发生问题的研究。
Califano团队通过VIPER算法,在美国政府资助的Cancer Genome Atlas数据库中,查看了来自10,000多个系统生物学+数学模型!双剑合璧挖掘肿瘤的致命弱点,鲁索替尼乳膏代购个体肿瘤样本的RNA-seq数据。研究小组发现不同类别的癌病,比之前人们系统生物学+数学模型!双剑合璧挖掘肿瘤的致命弱点,鲁索替尼乳膏代购认为的,有更多共同点。这项分析目前正在发表中,至今已鉴定出407个转录因子,这些转录因子在所有癌病样品中均显示可能为是关键基因。
冷泉港实验室癌病中心主任David Tuveson表示,Califano的算法的优势在于,它们能够研究包括RNA和蛋白质在内的整个调控网络。Tuveson将VIPER算法应用于寻找胰腺癌的治疗方法。
DarwinHealth将Califano的算法与有关药物怎样影响多个基因的实验信息数据库结合在一起,该数据库是通过对该公司已有文献和其他资料的审核而汇编的。遵循已建立的患病者组织转移扩散规则,世界各地的医生就能够将组织样本发送至哥伦比亚病理部门,在那里从细胞中提取RNA。
Califano和Bosker还向世界各地的其他研究人员授予DarwinHealth算法工具的使用权,帮助他们进行癌病靶点测试。
据报道,今年1月,北京大学肿瘤医院开始使用DarwinHealth的算法指导对患病者的治疗。领导该项目的张小田表示,如果临床治疗的早期结果显示对患病者有效,这项研究或将扩展到更多其他的医院。同时,张小田也表示说:“目前,这些临床研究都将集中在胃肠道肿瘤,特别是胃癌和食道癌上。”
原文链接https://www.sciencemag.org/news/2020/06/computer-algorithms-find-tumors-molecular-weak-spots?from=singlemessage&isappinstalled=0
参考文献
1, Andrea Califano, Mariano J Alvarez. The Recurrent Architecture of Tumour Initiation, Progression and Drug Sensitivity. Nat Rev Cancer. 2017 Feb;17(2):116-130.#肿瘤科普排位赛##肿瘤科普挑战赛#药物科普:瑞士诺华NOVARTIS制药产鲁索替尼(JAKAVI)、芦可替尼、Ruxolitinib、鲁索替尼、芦可替尼、鲁可替尼、鲁索利替尼。印度全球直邮药房:鲁索替尼在哪里有卖。

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